Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms