Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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