Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQF4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms