Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nudt21Q9CQF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms