Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms