Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQC3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms