Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Med4Q9CQA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms