Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms