Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NenfQ9CQ45 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms