Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms