Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl17Q9CPR4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl17Q9CPR4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl17Q9CPR4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms