Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bap1Q99PU7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms