Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt23Q99PS0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt23Q99PS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt23Q99PS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms