Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim11Q99PQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim11Q99PQ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim11Q99PQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms