Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2a1Q99PM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.6 ms