Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms