Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpin3Q99PI4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpin3Q99PI4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms