Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms