Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsmfQ99NF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms