Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rims1Q99NE5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms