Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms