Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1b4Q99ME6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms