Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaja3Q99M87 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms