Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms