Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nus1Q99LJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nus1Q99LJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms