Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms