Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cstf3Q99LI7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cstf3Q99LI7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms