Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnpo2Q99LG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnpo2Q99LG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnpo2Q99LG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms