Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EtfaQ99LC5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EtfaQ99LC5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms