Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmp1Q99KU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms