Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms