Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf19Q99KP6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf19Q99KP6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf19Q99KP6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf19Q99KP6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf19Q99KP6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms