Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ciao1Q99KN2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ciao1Q99KN2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms