Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps4Q99KG7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms