Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp11Q99K46 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp11Q99K46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms