Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufsp2Q99K23 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufsp2Q99K23 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms