Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Apobec3Q99J72 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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