Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg2Q925E0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sntg2Q925E0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms