Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc4Q924T3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms