Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csmd1Q923L3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csmd1Q923L3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms