Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clip1Q922J3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms