Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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