Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4bQ91ZP4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc5a4bQ91ZP4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms