Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf6Q91YR7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf6Q91YR7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms