Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rrp9Q91WM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp9Q91WM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms