Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Csde1Q91W50 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csde1Q91W50 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms