Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd3Q91W18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms