Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NifkQ91VE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NifkQ91VE6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms