Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps3Q91VB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps3Q91VB4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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