Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyocdQ8VIM5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MyocdQ8VIM5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms